细胞间的信息传递通过很小的信号分子进行。小信号分子由特定细胞产出，由靶细胞接收。这种信息传递系统运作的距离可长可短。蛋白质、脂肪酸衍生物、气体都能作为信号分子。一氧化氮气体就属于局部信息传递系统的一环，能发出信号，使人体血压降低。

激素是远距离信号分子，必须通过循环系统从产生地运送至靶细胞。植物细胞的细胞壁具有刚性，因此有彼此联通的细胞质，称为胞间连丝。胞间连丝使细胞间可以传递信息。动物体内，使临近细胞间进行物质传递的是间隙连接。