至今已发现11个真正标本和许多羽毛化石。下面列出了迄今为止的9项发现：

哈勒姆标本：1855年在芮登柏格附近发现，五年后又发现了它的羽毛。因为当时还不知道它是早期鸟类的化石，因此被归为翼手龙（非恐龙）;1970年，约翰·奥斯特罗姆（John Ostrom）检查该化石，发现了羽毛存在的迹象，也揭示出它的真实身份。目前它存放于荷兰哈勒姆的泰勒斯博物馆中。

伦敦标本：1861年在兰格纳尔泰姆附近发现。最终，英国自然历史博物馆在理查德·欧文（Richard Owen）的指示下，从卡尔·哈伯伦（Carl Haberlein）手中购入。

柏林标本：1876和1877年在布鲁门伯格附近被发现，包括完整的头骨（尽管遭到严重挤压），目前收藏在洪保德自然博物馆。

艾希施泰特标本：1951或1955年发现，是所有印石版始祖鸟中最小的一只，约是其他标本的三分之二大小；它的头骨是目前保存最好的，牙齿结构与其他标本不同，肩胛骨也不像其他标本那么僵化。很多科学家认为它代表另一种生物，其他科学家则认为它只是一只青少年时期的印石版始祖鸟或来自一个饮食不同的地区，所以构造不同。目前它存放于德国艾希施泰特侏罗纪博物馆中。

马克斯伯格标本：1958年在兰格纳尔泰姆发现，就在伦敦标本附近。该化石只有鸟的躯干，它是唯一一个私人拥有的标本。发现化石的人是爱德华·欧毕屈（Eduard Opitsch），在1991年去世，他去世后标本便不知所终。据推测应是被秘密卖掉了，所以至今标本所在何处仍是一个谜。

索伦霍芬标本：20世纪60年代在艾希施泰特县附近发现，一开始被认为是一只秀颌龙。但在实验室制作标本时，科学家们注意到它的胳膊相对于其体形来说过长，还发现了羽毛。因此这个生物被列入印石版始祖鸟的名单中。目前它存放于索伦霍芬的市长穆乐博物馆。

慕尼黑标本（前称为索伦霍芬AV标本）:1991年发现。它的胸骨较小且僵化，有羽毛覆盖的痕迹。1993年描述它的论文发表后，被一些科学家归为一个新种类：巴伐利亚始祖鸟。目前存放于慕尼黑的古生物博物馆。

市长穆勒标本：1997年发现，这一碎片标本目前存放于市长穆勒博物馆。

瑟莫波利斯标本：发现于德国，在2005年被描述，长期被私人储藏。