形成天然珍珠的原因有两种：一种是砂粒、小虫或虫卵等异物，偶然侵入蚌壳内，与部分外套膜表皮细胞一起陷入蚌的结缔组织，蚌的外套膜表皮细胞组织分裂增殖成珍珠囊，包围异物，分泌珍珠质，最终形成珍珠。这样形成的珍珠是有核的。另一种为外套膜表皮细胞组织的一部分因病变或受伤等原因，脱离原来的部位，进入结缔组织中，分裂增殖形成珍珠囊进而形成珍珠。这样的珍珠是无核的。