一旦发现首个骨头，对其进行评估并做出进一步挖掘的决定后，开采余下化石的过程就开始了。同媒体传递的观念相反，这是项长期、艰难、劳动力密集的实践，尤其是当恐龙比较大、骨架又比较完整时。首先，必须用合适工具移开覆盖的岩石，工具从炸药、推土机、手提钻一直到凿子和铁铲。一旦上覆岩石被移走，便要用小凿和牙刷等更精细的工具来使上部化石的表面显露出来。为防止这些暴露的化石干燥、破裂或氧化，还需要使用合适的化学硬化剂，使它们变得稳定。

接着要完整绘制暴露出的骨头表面，并做出挖掘整个骨架的计划。第一步是分离各块骨头或骨头组合，在它们周围挖出垂直的土沟，留出厚厚的岩石作为保护。挖沟时，任何暴露出的骨头都需要加硬化剂稳定，每块骨头都要用不褪色油墨编号，并填写到记录表里。

顶部和侧面暴露出的骨头要用湿报纸、面巾纸或纸巾包上，接着裹上一层浸透石膏的麻袋条。石膏干了之后，这层外衣就将化石封进岩石中，避免它破裂或损坏。接下来，要小心地移出下方的岩石，每次只能移一点。任何暴露出的骨头都要被涂上硬化剂稳定，新挖出的区域也要被封上石膏外衣。随着下方岩石减少，用木头或金属片来撑起裹了石膏的化石块。

当岩石足够小，其他部分也被石膏覆盖后，这个化石块便可被翻转过来了。但在此之前，要先在外衣上用永久墨水标明记号，写明其中每块化石的图示编号、方向箭头、出土日期、挖掘点名称及编号和其他博物馆修复所需的信息。等该化石块被翻转，岩石中任何裸露区域都披了石膏衣，这块或这组化石便可以运送到博物馆了。