基于一具恐龙骨架，科学家有多种解读恐龙柔软部位的方法。举例来说，保存完好的骨头上留有肌肉附着的痕迹。一个动物的头骨大小，有些时候能告诉我们相应的大脑大小。骨孔和骨头的中空部分，可以显示神经通路。最重要的是，将恐龙的骨头与那些现有动物的骨头对比，可得知某些恐龙的大小、解剖结构、力量，有时还能知道一只恐龙的内部器官构造。