对于医疗事故技术鉴定和司法鉴定，由于二者的启动程序、鉴定人员的组成、鉴定方式、鉴定内容方面的不同，必然导致两种鉴定结论在司法诉讼中的可信程度不同。比较这两种鉴定，从程序方面来讲，司法鉴定优于医疗事故技术鉴定。《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第47条规定：“证据应当在法庭上出示，由当事人质证。未经质证的证据，不能作为认定案件事实的依据。当事人在证据交换过程中认可并记录在卷的证据，经审判人员在庭审中说明后，可以作为认定案件事实的依据。”对于医疗事故的技术鉴定，其是卫生行政部门处理医疗事故的一个环节与依据，而法院在审理的过程中并不一定予以采纳，质证的结果则直接关系到鉴定结论的效力。而司法鉴定则是司法机关公断医疗纠纷案件的常规程序，更具效力。