爬行动物的腿部要比两栖动物的腿更有力量，可以有效地支撑身体，使得爬行动物的身体可以更大，具有奔跑的能力。爬行动物的肺部也比两栖动物发育更完善，与后者囊状肺部相比，用于气体交换的表面积大大增加。同样为三腔心脏，爬行动物的心脏比两栖动物的效能更高。此外，它们的皮肤也覆盖着坚硬、干燥的鳞片，使水分损失降至最低。但是，爬行动物最重要的进化是羊膜卵的出现，羊膜卵内的胚胎能够在陆地上生存和发育。卵由一层防止胚胎脱水的保护壳覆盖。